在列管式換熱器的運行中，要定期給設備管路的清洗，要做好檢查和維護工作。主機在起停的過程中，因為列管式換熱器的蛇形管設計存在著壓力差和溫度差，壓力差與溫度差將致使銅管發作彈性效應，因為銅材、垢質膨脹系數不同很大，所以列管式換熱器有主動脫垢的功用。
        在運轉過程中因為制冷劑在列管式換熱器中發作兩相變換發作高頻運動，所以很難結垢，致使水垢無法附著管壁；生產列管式換熱器時應進行預膜防垢處置，以免塵垢晶體在銅管外表上附著；選用少數接連排水設備，將冷卻水的鈣離子的濃縮倍數控制在范圍內，以免垢質的分出；還有可以設置預冷器，使列管式換熱器管的外表蒸騰溫度在50℃以下，選用大水量密集型布水器，讓列管式換熱器管外表時辰被水膜包覆，沒有干枯點。
        當換熱盤管的外表溫度低于50℃時，發作的垢質疏松，易于沖刷，當其外表溫度高于50℃時，發作的垢質比較難清理。設置檔水板，使較高溫度的冷凝管上無水沾附，以免列管式換熱器結垢。
        由于兩流體的溫度不同，使列管式換熱器的管束和殼體的溫度也不相同，因此它們的熱膨脹程度也有差別。若兩流體溫差較大（50℃以上）時，就可能由于熱應力而引起設備的變形、彎曲或破裂，因此需要考慮這種熱膨脹的影響。